Основными структурными единицами организации являются структурные подразделения (отделы). Данные подразделения осуществляют управление одной из областей деятельности ООО «АйТэКо». Общее управление работой осуществляют Генеральный директор и Директор. Все структурные подразделения находятся по адресу г. Подольск, ул. Комсомольская, д. 28, стр. 2, 5 этаж, офис № 504, 506, 507, 508, за обособленного подразделения г. Ступино.